会計検査院は、総合評価落札方式の手続きが不適切だとして農林水産省に改善を求めた。同省は総合評価落札方式を採用した調査業務などの入札で、具体的な仕様や予定価格を定めないまま公告。技術点の評価が最も高かった入札者から参考見積書を入手し、参考見積額の金額をそのまま予定価格にしていた。

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